基因表達譜
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表達譜的應用:
(1) 若是沒有參考基因組的物種, 建議先進行 5 Gb 的 paired end RNA_seq深度測序與contig組裝, 大致上約可以組裝出30,000 - 50,000個contigs 。 (2) 之後可以對每個實驗樣本進行深度約0.5 -1 Gb的 single end RNA_seq, 再利用如Bowtie等生物資訊軟體對之前組裝好的contigs進行mapping與表達量計算 。 (3) 實驗者可以利用差異表現的基因資訊, 設計如RT-PCR, 實驗去驗證基因表現的相對量。 (3) 最後, 實驗者可以利用如RNAi或基因過度表達等技術去驗證該有興趣基因的功能。
實驗設計
已有定序參考基因組圖譜。推薦實驗採用Illumina平臺建庫,進行表達譜定序。 XX 組樣本純化RNA，反轉錄合成cDNA，構建Illumina SE定序文庫。推薦數據量為每組 XXX M Reads，一共 XXX 組，共計 XXX M Reads。有效資料將用於後期生物資訊分析。 |
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力鈞生技公司的技術優勢可以提供客戶下列訊息:
(1) 任意物種的高通量分析
RNA-seq測序能夠研究與發掘任意物種中的轉錄本，無需任何預先的序列資訊。
(2) 高靈敏度
每個獨立的測序通道可以檢測多達5Gb的RNA分子讀序，為轉錄本的發現和研究提供了極大的資料深度與覆蓋率，能夠檢測表現豐度極低的稀有RNA轉錄本。
(3) 高品質資料與可信度
RNA測序具有極大的測序通量，靈敏度與準確性，無需重複實驗，同時其產生的定量資料與即時定量PCR結果具有高度的一致性。
(4) 加值型的生物資訊分析
力鈞生技公司尤其專精於RNA的測序與生物訊息註解，可以注釋RNA的資訊，分析其相對表達水準。能夠使用最新最完整的公用資料庫注釋原始資料中已知的RNA。
(5) 價錢合理的NGS測序服務
力鈞生技公司採用Illumina Hiseq2000/2500新型NGS測序儀，可以增加測序通量並解有效降低測序成本，保證提供同業中最合理的測序服務價格。
力鈞生物RNA-Seq服務樣品要求
樣品要求 Total RNA
1) 樣品純度：OD 260/280值應在1.9～2.2 之間，RNA 28S:18S≥1.5 推薦 RIN ≥8；DNA 應該去除乾淨。
2) 樣品濃度：最低濃度不低於100ng/µl。
3) 樣品總量：每個樣品總量不少於15µg。
4) 樣品溶劑：要溶解在H2O或TE (pH 8.0)中。
(1) 任意物種的高通量分析
RNA-seq測序能夠研究與發掘任意物種中的轉錄本，無需任何預先的序列資訊。
(2) 高靈敏度
每個獨立的測序通道可以檢測多達5Gb的RNA分子讀序，為轉錄本的發現和研究提供了極大的資料深度與覆蓋率，能夠檢測表現豐度極低的稀有RNA轉錄本。
(3) 高品質資料與可信度
RNA測序具有極大的測序通量，靈敏度與準確性，無需重複實驗，同時其產生的定量資料與即時定量PCR結果具有高度的一致性。
(4) 加值型的生物資訊分析
力鈞生技公司尤其專精於RNA的測序與生物訊息註解，可以注釋RNA的資訊，分析其相對表達水準。能夠使用最新最完整的公用資料庫注釋原始資料中已知的RNA。
(5) 價錢合理的NGS測序服務
力鈞生技公司採用Illumina Hiseq2000/2500新型NGS測序儀，可以增加測序通量並解有效降低測序成本，保證提供同業中最合理的測序服務價格。
力鈞生物RNA-Seq服務樣品要求
樣品要求 Total RNA
1) 樣品純度：OD 260/280值應在1.9～2.2 之間，RNA 28S:18S≥1.5 推薦 RIN ≥8；DNA 應該去除乾淨。
2) 樣品濃度：最低濃度不低於100ng/µl。
3) 樣品總量：每個樣品總量不少於15µg。
4) 樣品溶劑：要溶解在H2O或TE (pH 8.0)中。
