力鈞生技公司microRNA測序服務
microRNA是長度為21-23nt的非編碼小RNA分子，可以通過沉默或降解其靶基因mRNA來調控基因的表達。研究發現microRNA在正常發育以及在疾病發生過程中扮演重要的角色。目前研究microRNA的方法主要是通過即時定量PCR以及基因晶片技術，這些方法主要關注microRNA的表達與定量，無法尋找和發現新的microRNA分子。基於Illumina高通量測序平臺的測序技術，使得研究人員能夠直接對樣本中指定大小的所有microRNA分子進行NGS測序，在無需任何序列資訊的前提下研究microRNA的表達譜，並在此基礎上發現和鑒定出新的microRNA分子。
力鈞生技公司的技術優勢可以提供客戶下列訊息:
(1) 數位化信號
基於NGS測序技術，可以較傳統晶片雜交呈現更為精準的定量方式，而且有利於區分相同家族以及序列極為相似的不同microRNA分子。
(2) 任意物種的高通量分析
microRNA測序能夠研究與發掘任意物種中的microRNA分子，無需任何預先的序列資訊以及二級結構資訊。
(3) 高靈敏度
每個獨立的測序通道可以檢測多達1000萬的microRNA分子讀序，為microRNA分子的發現和研究提供了極大的資料深度與覆蓋率，能夠檢測表現豐度極低的稀有microRNA轉錄本。
(4) 高品質資料與可信度
microRNA測序具有極大的測序通量，靈敏度與準確性，無需重複實驗，同時其產生的定量資料與即時定量PCR結果具有高度的一致性。
(5) 加值型的生物資訊分析
力鈞生技公司尤其專精於microRNA的測序與生物訊息註解，可以注釋microRNA的基因組資訊，分析其相對表達水準。能夠使用最新的microRNA公用資料庫注釋原始資料中已知的microRNA，還能夠進一步發掘全新的microRNA種類及異構體（isomiRs），並且註解microRNA的可能靶基因資訊。
(6) 價錢合理的NGS測序服務
力鈞生技公司採用Illumina Hiseq2000/2500新型NGS測序儀，可以增加測序通量並解有效降低測序成本，保證提供同業中最合理的測序服務價格。
microRNA是長度為21-23nt的非編碼小RNA分子，可以通過沉默或降解其靶基因mRNA來調控基因的表達。研究發現microRNA在正常發育以及在疾病發生過程中扮演重要的角色。目前研究microRNA的方法主要是通過即時定量PCR以及基因晶片技術，這些方法主要關注microRNA的表達與定量，無法尋找和發現新的microRNA分子。基於Illumina高通量測序平臺的測序技術，使得研究人員能夠直接對樣本中指定大小的所有microRNA分子進行NGS測序，在無需任何序列資訊的前提下研究microRNA的表達譜，並在此基礎上發現和鑒定出新的microRNA分子。
力鈞生技公司的技術優勢可以提供客戶下列訊息:
(1) 數位化信號
基於NGS測序技術，可以較傳統晶片雜交呈現更為精準的定量方式，而且有利於區分相同家族以及序列極為相似的不同microRNA分子。
(2) 任意物種的高通量分析
microRNA測序能夠研究與發掘任意物種中的microRNA分子，無需任何預先的序列資訊以及二級結構資訊。
(3) 高靈敏度
每個獨立的測序通道可以檢測多達1000萬的microRNA分子讀序，為microRNA分子的發現和研究提供了極大的資料深度與覆蓋率，能夠檢測表現豐度極低的稀有microRNA轉錄本。
(4) 高品質資料與可信度
microRNA測序具有極大的測序通量，靈敏度與準確性，無需重複實驗，同時其產生的定量資料與即時定量PCR結果具有高度的一致性。
(5) 加值型的生物資訊分析
力鈞生技公司尤其專精於microRNA的測序與生物訊息註解，可以注釋microRNA的基因組資訊，分析其相對表達水準。能夠使用最新的microRNA公用資料庫注釋原始資料中已知的microRNA，還能夠進一步發掘全新的microRNA種類及異構體（isomiRs），並且註解microRNA的可能靶基因資訊。
(6) 價錢合理的NGS測序服務
力鈞生技公司採用Illumina Hiseq2000/2500新型NGS測序儀，可以增加測序通量並解有效降低測序成本，保證提供同業中最合理的測序服務價格。
miRNA Seq 生資分析服務
1． 基本資料分析
資料產出統計：對測序結果進行序列質量控制（Base calling），去除污染及接頭序列；統計結果包括：測定的序列（Reads）長度、Reads數量、資料產量。
2． 高級資料分析
1) microRNA長度分佈統計以驗證實驗可靠性；
2) microRNA鹼基使用偏好性鑒定以檢驗資料品質；
3) 將定序得到的序列與miRBase資料庫中已知rRNA、tRNA、重複區、RefSeq資料庫進行比對，
對已知microRNA進行生物註解；
4) 將定序得到的序列與該物種全基因體序列進行比對分析，通過折疊模型預測是否有新的microRNA存在；
5) 不同組織間microRNA表達譜分析；
6) 兩個樣本間microRNA差異表達分析；
7) microRNA表達模式聚類分析(cluster analysis)；
8) microRNA作用靶基因預測 (target gene prediction)。
1． 基本資料分析
資料產出統計：對測序結果進行序列質量控制（Base calling），去除污染及接頭序列；統計結果包括：測定的序列（Reads）長度、Reads數量、資料產量。
2． 高級資料分析
1) microRNA長度分佈統計以驗證實驗可靠性；
2) microRNA鹼基使用偏好性鑒定以檢驗資料品質；
3) 將定序得到的序列與miRBase資料庫中已知rRNA、tRNA、重複區、RefSeq資料庫進行比對，
對已知microRNA進行生物註解；
4) 將定序得到的序列與該物種全基因體序列進行比對分析，通過折疊模型預測是否有新的microRNA存在；
5) 不同組織間microRNA表達譜分析；
6) 兩個樣本間microRNA差異表達分析；
7) microRNA表達模式聚類分析(cluster analysis)；
8) microRNA作用靶基因預測 (target gene prediction)。
力鈞NGS small RAN-Seq 生資分析服務實例展示圖
將定序得到的序列與miRBase資料庫，已知rRNA、tRNA、重複區、RefSeq資料庫比對，對有註解的reads的來源進行分類統計。
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將得到的reads 在基因體上定位。對定位的區域進行分類。並統計出各長度的reads中，各種類RNA的數目
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將得到的reads 在基因體上定位。對定位的區域進行分類。並統計出各長度的reads中，各種類RNA的數目
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鑒定新的miRNAs流程 / osa莖環結構預測
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家族組織特異表達
Osa 根部偏好表達的miRNA
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左邊是下調的microRNA，右邊是上調的microRNA
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microRNA表達差異。找到了在紋狀體中高表達的microRNA。這些microRNA很多屬於同一microRNA家族。
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